Die Organe der Zahnärztekammer sind die Kammerversammlung und der Vorstand. Die mindestens einmal pro Jahr stattfindende Kammer- versammlung mit 60 Zahnärztinnen und Zahnärzten wird für die Dauer von fünf Jahren von allen Kammerangehörigen in Niedersachsen gewählt. Die Mitglieder der Kammerversammlung wählen aus ihrer Mitte den Vorstand, der aus dem Präsidenten, dem Vizepräsidenten und fünf weiteren Mitgliedern besteht. Dieser Vorstand führt die laufenden Geschäfte der Kammer.

Die Kammerversammlung beschließt über die Satzung, die Berufs- ordnung, die Weiterbildungsordnung, die Notfalldienstordnung, die Geschäftsordnung, die Haushalts- und Kassenordnung. Die aufsichts- rechtliche Kontrolle obliegt dem Nieders. Ministerium für Soziales, Frauen, Familie und Gesundheit.